但在实践中，我们却发现，数码印刷对于上海杂志印刷来说也带来了不少问题。比如对于低档次的数码印刷机而言，在进行平网和大底纹的印刷时，非常容易出现印不均匀的现象。而且低档印刷机的印刷线数大多是每英寸100线左右，甚至没有传统的印刷报纸的线数高。
同时，数码印刷机应用的墨粉由于颗粒比较大，非常容易损失图像的细节，表现力不丰富。因此，如果文件中其有非常多的图形图像，那么一定要选择高档次的数码印刷机。这是一些中小上海杂志印刷厂的通病，而解决方法就是对设备更新换代。
此外，数码印刷机与其他的机器一样，也要使用人员对其进行精心的维护与保养。如果出现了维护不力的现象，则很容易导致杂志字迹不清、甚至有线痕，或者出现缺字断划的情况。因此，印刷机的检查工作一定要做到位。与此同时，上海杂志印刷讲求品质，对于数码印刷机的各项性能，工作人员一定要全面掌握，一旦发现问题，要及时有效地解决。
当然，数码印刷产品的质量问题并不完全是因为印刷机导致的，还包括一些其他的因素：原稿件的质量因素，制版的因素，纸张、油墨的因素，温度、湿度等印刷环境的因素等。同样的，还有操作人员的技术与能力因紊，后加工的相关工序因素等。这些因素在一定程度上都会对上海杂志印刷的质量起到至关重要的作用。
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